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Shibboleth IdP 3には同等の機能はありません。
ストレージ
uApprove JPでは、送信情報の記録をJDBCを利用してMySQLやHSQLに保存します。
Shibboeleth IdP 3では、送信情報の記録をストレージ機能を介してブラウザのCookie、JDBCを利用したSQLデータベース、Memcachedなどに保存します。uApprove JPと同じSQLデータベースを利用したとしても使用するテーブルが異なるためuApprove JPからアップグレードすることはできません。