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CentOS 6のtomcat6パッケージを使っている場合には、/etc/sysconfig/tomcat6 にてJAVA_OPTSを設定可能ですので、末尾に以下の行を追加してください。

JAVA_OPTS="${JAVA_OPTS} -Djdk.tls.trustNameService=true"

学認提供自動起動スクリプト(/etc/init.d/tomcat6 or /etc/init.d/tomcat)を使っている場合には、CATALINA_OPTSにて設定しておりますので、以下の行を修正してください。

※端末のサイズによっては複数行で表示されているかもしれませんが、一行で入力してください。

この問題はOracle JDKに限らずOpenJDKでも発生します。
対応するOpenJDKのバージョン（RHEL/CentOS上）は以下ですが、これ以降のものにも問題がある可能性がありますのでご注意ください。該当するOpenJDKのバージョン（RHEL/CentOS上）は以下ですが、これ以降のものにも問題がある可能性があります。
java-1.6.0-openjdk-1.6.0.36-1.13.8.1.el5_11
java-1.7.0-openjdk-1.7.0.85-2.6.1.3.el5_11
java-1.7.0-openjdk-1.7.0.85-2.6.1.3.el6_6
java-1.7.0-openjdk-1.7.0.85-2.6.1.2.el7_1
java-1.8.0-openjdk-1.8.0.51-0.b16.el6_6
java-1.8.0-openjdk-1.8.0.51-1.b16.el7_1