ロゴは、IdP・SP一覧 https://www.gakunin.jp/participants/
に表示されます。
IdPが登録したロゴは、加えて、SP側のDSに機関名称と共に表示される場合もあるようです。また、SP側のDSに機関名称と共に表示される場合もあるようです。
次期学認DS（埋め込み型含む）でもロゴを並べて表示するようになります。
SPが登録したロゴは、IdPにおける属性送信同意画面（例: uApproveJP）で利用者に対して表示されます。また、学認クラウドゲートウェイサービスでも表示される場合があるようです。