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2.6.xで動作している設定ファイルは全て3.0.xでも動作します。上記手順でアップデートを行ってください。ただし、旧設定ファイルでは新機能が使えないほかいくつか不要なものがございますので後日以下の1.の手順を実施することをお勧めします。
1. SPアップデート後の作業
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不要なパッケージの削除
libsaml, libxmltooling, libxml-security-c, liblog4shibが合わせてバージョンアップしパッケージ名が変更になっています。また、CentOS 7ではBaseリポジトリのxerces-cパッケージを使用していたものが独自のlibxerces-c-3_2パッケージを使用するようになっています。古いバージョンは削除されないようなので、他で使っていなければ削除してしまいましょう。
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不要なファイルの削除
2.xで/var/log/shibboleth-www/以下に出力されていたログは3.0では/var/log/messagesに出力されるようになりました。既存のログファイルに有益なものはないと思いますので削除してかまいません。
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